上海生物芯片有限公司成立于2001年8月，现有股东包括上海科技创业投资（集团）有限公司、上海张江（集团）有限公司、中国科学院上海营养与健康研究所、复旦大学、上海交通大学、上海交通大学医学院附属瑞金医院以及上海博星基因芯片有限公司。2003年2月，国家发展与改革委员会批准上海生物芯片有限公司建设和运行生物芯片上海国家工程研究中心项目，并正式予以命名，项目总投资达2.9亿元人民币。
公司（中心）坐落于上海浦东张江高科技园区生物医药产业基地，总占地面积4万平方米，建筑面积2万多平方米，现有员工300余人。依据国家发展与改革委员会对生物芯片上海国家工程研究中心项目的建设任务要求以及公司发展战略，公司化国家工程研究中心专注于生物芯片在生命科学研究、医疗保健和药物开发等领域的应用与推广。经过二十余年的建设与发展，已确立了以生物样本资源库、组织芯片、基因表达谱芯片和测序等为核心平台的技术创新服务体系，以及以分子医学诊断技术和产品研发生产为核心竞争力的产业化体系，形成了科研和药物研发技术服务、分子医学检验服务以及分子诊断产品研发生产销售三大主营业务。
目前，公司（中心）已步入科研与合作、产品研发生